De waterhuishouding wordt in Nederland gereguleerd en onderhouden door de Waterschappen. De Geleenbeek en Rode Beek vallen onder het Waterschap Roer en Overmaas. Dit schap heeft zich sterk aan het Beekdalenproject gecommitteerd.

Het levert een aanzienlijk deel van de financiële middelen die nodig zijn om de herinrichting van de beekdalen in al zijn facetten te realiseren. Ook heeft Natuurmonumenten zich ten volle achter het project geschaard. Zij brengen onder andere gronden langs de beken in en nemen de regie over het onderhoud op zich.

Voorts hebben de gemeenten waar de beken doorheen stromen hun steun aan de realisatie van het Beekdalenproject toegezegd. Met elkaar moeten zij de kosten dekken. De gemeenten Sittard-Geleen en Schinnen hebben daarbij de handen ineengeslagen in het kader van Landschapspark De Graven. De fondsen voor de renaturatie van de Geleenbeek vanaf de Mulderplas tot aan kasteel Millen zijn reeds toegezegd en gereserveerd c.q. besteed.

Vervolgens betaalt de Provincie 50% van de gemaakte kosten terug uit de fondsen die onder andere in het kader van het rijksprogramma Vitaal Platteland ter beschikking staan. Daarbij lopen de contacten onder andere via de gebiedscommissies die de planning en ontwikkeling van het Vitaal Platteland regionaal coördineren.